突如其来的异形之物，超出一般合金的身体强度，让各个政府不得不研究可以针对这类怪物的武器。
在一次战场的清理之中，人们发现这些异形被杀死之后，只有头上的红石头可以留下，人们将这些红色晶体带回安全区，让科研所进行研究。人们惊奇的发现这些石头就像一块一块的电池一样，可以提供能量的供应。这一发现也使得回归原始的人们可以重新补充能源，以完善基础设施。
灾变二月后，旧的秩序被破坏，原有的规则不再适用于当下，在大纵深的分割下，统一的政府逐渐分裂成聚集的自治城市，依靠着能量晶石，每一个独立的城市完全可以依靠自身进行循环发展。细数之下，共有100座城正式接纳灾民。过去的历史被湮没，至此称为破灭元年。
元年四月，异形之物再次涌出海面，各个城市也准备好了迎击的武器——由晶核改造的次声波武器。
这次由晶核改造的次声波武器被发明出来，是因为在原先的火药类武器大规模消耗后，人们用次声波武器反击时发现，这种异形对于自己所擅长的攻击方式反而没有多少抵抗能力，次声波武器可以轻易穿过异形之物的坚韧身躯，让嵌入它们身体的红色晶石脱落，躯体化作黑灰，这种遗留的黑灰具有一定毒性，恶化土地，由此民众也称这些异形之物为“恶灰”
第一天的冲锋，恶灰被针对性的武器阻挡在外，人们不欢呼喜悦。待局势好转，便有胆大之人去战场之中捡红色晶核。作为新世界的核心，这些红色晶核是新兴城市的根本之物。
随着一天天的过去，大量恶灰仍未能再突破城市，只留下了一颗颗的晶核。然而一周时间已过，这一次的灾难并未退去。
一号城，原云贵高原所在地，因地势优越，且有武器遗留，所以较早的组织人民建立起了安全区。
此时的城内，不参战的人们躲藏在防空洞中，后勤人员不断地组织车辆向战线输送晶核和物资。
“没结束？都没有结束？”在城市中心的政府大楼内，一个有些鬓白，身着正装的中年人接着来电。
“唉”，胡宗宪挂了电话，瘫坐在办公椅上，眉头紧锁，思绪乱飞。目前情况正如他们这些城主商讨的那样——如果灾难一次比一次更加有破坏性怎么办？
“若灾难一直就如刚开始那样，自保尚可，可眼下是不能奢望了，时间太短了。”
沉默一会，胡宗宪把手放在了面前的电话上，沉吟一会，又放下了。他的食指不断敲打着桌子，细细听着，依稀可闻战争咆哮之声。突然，胡宗宪面色肃然起来，长叹一声，握起电话，拨通了军部。
“目前恶灰数量如何？”
“已恢复到了第一次灾变数量，再挺一个星期应该就可击退它们。”
“时间太长!城里物资只允许三天!三天后能源可用。”
对方没有回话，胡宗宪明白他的意思，三天内法解决。胡宗宪喉咙一动，空着的手紧握成拳，吩咐道：“启动达尔文计划”。